Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uchl5Q9WUP7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uchl5Q9WUP7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uchl5Q9WUP7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uchl5Q9WUP7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Uchl5Q9WUP7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uchl5Q9WUP7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Uchl5Q9WUP7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uchl5Q9WUP7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uchl5Q9WUP7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Uchl5Q9WUP7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uchl5Q9WUP7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uchl5Q9WUP7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uchl5Q9WUP7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms