Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU66

Sfrp5, Secreted frizzled-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp5Q9WU66 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp5Q9WU66 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sfrp5Q9WU66 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfrp5Q9WU66 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp5Q9WU66 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms