Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Skp1Q9WTX5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skp1Q9WTX5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skp1Q9WTX5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms