Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv2Q9WTR1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv2Q9WTR1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv2Q9WTR1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpv2Q9WTR1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpv2Q9WTR1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms