Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc2Q9R244 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc2Q9R244 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trpc2Q9R244 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc2Q9R244 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms