Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TapbpQ9R233 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TapbpQ9R233 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TapbpQ9R233 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms