Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trex2Q9R1A9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trex2Q9R1A9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms