Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Lamc3Q9R0B6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Lamc3Q9R0B6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Lamc3Q9R0B6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
Lamc3Q9R0B6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Lamc3Q9R0B6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Lamc3Q9R0B6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Lamc3Q9R0B6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Lamc3Q9R0B6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Lamc3Q9R0B6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Lamc3Q9R0B6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Lamc3Q9R0B6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Lamc3Q9R0B6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Lamc3Q9R0B6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Lamc3Q9R0B6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Lamc3Q9R0B6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Lamc3Q9R0B6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Lamc3Q9R0B6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Lamc3Q9R0B6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Lamc3Q9R0B6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Lamc3Q9R0B6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Lamc3Q9R0B6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Lamc3Q9R0B6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Lamc3Q9R0B6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Lamc3Q9R0B6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Lamc3Q9R0B6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Lamc3Q9R0B6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Lamc3Q9R0B6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Lamc3Q9R0B6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Lamc3Q9R0B6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
Lamc3Q9R0B6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Lamc3Q9R0B6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Lamc3Q9R0B6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Lamc3Q9R0B6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Lamc3Q9R0B6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Lamc3Q9R0B6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Lamc3Q9R0B6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Lamc3Q9R0B6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Lamc3Q9R0B6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Lamc3Q9R0B6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Lamc3Q9R0B6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms