Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek3Q9R0A5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nek3Q9R0A5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek3Q9R0A5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek3Q9R0A5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms