Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tk2Q9R088 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tk2Q9R088 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tk2Q9R088 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms