Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhl3Q9R059 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fhl3Q9R059 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.2 ms