Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphs1Q9QZS7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nphs1Q9QZS7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphs1Q9QZS7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms