Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf4Q9QZS2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf4Q9QZS2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms