Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClnkQ9QZE2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClnkQ9QZE2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ClnkQ9QZE2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ClnkQ9QZE2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ClnkQ9QZE2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ClnkQ9QZE2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClnkQ9QZE2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClnkQ9QZE2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClnkQ9QZE2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ClnkQ9QZE2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ClnkQ9QZE2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms