Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf3Q9QXK7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf3Q9QXK7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpsf3Q9QXK7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf3Q9QXK7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms