Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trp53inp1Q9QXE4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trp53inp1Q9QXE4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trp53inp1Q9QXE4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms