Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phc2Q9QWH1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phc2Q9QWH1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phc2Q9QWH1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms