Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mid2Q9QUS6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mid2Q9QUS6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms