Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkl2Q9QUK0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkl2Q9QUK0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdkl2Q9QUK0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl2Q9QUK0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl2Q9QUK0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl2Q9QUK0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl2Q9QUK0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl2Q9QUK0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl2Q9QUK0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkl2Q9QUK0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkl2Q9QUK0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms