Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC8

Epb41l4b, Band 4.1-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4bQ9JMC8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l4bQ9JMC8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l4bQ9JMC8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l4bQ9JMC8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l4bQ9JMC8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l4bQ9JMC8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l4bQ9JMC8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l4bQ9JMC8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l4bQ9JMC8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l4bQ9JMC8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l4bQ9JMC8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb41l4bQ9JMC8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb41l4bQ9JMC8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Epb41l4bQ9JMC8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms