Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42ep4Q9JM96 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms