Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dclk1Q9JLM8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dclk1Q9JLM8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dclk1Q9JLM8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dclk1Q9JLM8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dclk1Q9JLM8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dclk1Q9JLM8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms