Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2l2Q9JLG4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2l2Q9JLG4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2l2Q9JLG4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms