Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gde1Q9JL56 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gde1Q9JL56 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Gde1Q9JL56 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Gde1Q9JL56 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gde1Q9JL56 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gde1Q9JL56 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gde1Q9JL56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gde1Q9JL56 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gde1Q9JL56 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.1 ms