Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Cnot9Q9JKY0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Cnot9Q9JKY0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Cnot9Q9JKY0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21,08■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21,06■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Cnot9Q9JKY0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Cnot9Q9JKY0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20,93■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Cnot9Q9JKY0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20,88■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,8 ms