Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM1

Slc29a1, Equilibrative nucleoside transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc29a1Q9JIM1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc29a1Q9JIM1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc29a1Q9JIM1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc29a1Q9JIM1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms