Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl1Q9JI74 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl1Q9JI74 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl1Q9JI74 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl1Q9JI74 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl1Q9JI74 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms