Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ropn1Q9ESG2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ropn1Q9ESG2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ropn1Q9ESG2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms