Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22,28■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22,27■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,27■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22,25■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22,25■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22,21■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
C1qtnf3Q9ES30 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22,16■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22,15■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22,15■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
C1qtnf3Q9ES30 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22,13■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22,11■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
C1qtnf3Q9ES30 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22,07■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,05■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,05■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22,02■■□□□ 1,12
C1qtnf3Q9ES30 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms