Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Irx6Q9ER75 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Irx6Q9ER75 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Irx6Q9ER75 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irx6Q9ER75 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms