Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a44Q9EQW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a44Q9EQW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp3a44Q9EQW4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp3a44Q9EQW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp3a44Q9EQW4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms