Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr9Q9EQU3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr9Q9EQU3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms