Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH3

Vps35, Vacuolar protein sorting-associated protein 35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps35Q9EQH3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps35Q9EQH3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps35Q9EQH3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps35Q9EQH3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps35Q9EQH3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps35Q9EQH3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps35Q9EQH3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps35Q9EQH3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps35Q9EQH3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps35Q9EQH3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms