Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsc1Q9EP53 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tsc1Q9EP53 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tsc1Q9EP53 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsc1Q9EP53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsc1Q9EP53 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsc1Q9EP53 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsc1Q9EP53 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsc1Q9EP53 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsc1Q9EP53 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsc1Q9EP53 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsc1Q9EP53 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsc1Q9EP53 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsc1Q9EP53 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsc1Q9EP53 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsc1Q9EP53 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tsc1Q9EP53 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsc1Q9EP53 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms