Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCV4

Rmdn1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn1Q9DCV4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rmdn1Q9DCV4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rmdn1Q9DCV4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rmdn1Q9DCV4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rmdn1Q9DCV4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rmdn1Q9DCV4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rmdn1Q9DCV4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rmdn1Q9DCV4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rmdn1Q9DCV4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rmdn1Q9DCV4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmdn1Q9DCV4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rmdn1Q9DCV4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rmdn1Q9DCV4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmdn1Q9DCV4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmdn1Q9DCV4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmdn1Q9DCV4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmdn1Q9DCV4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmdn1Q9DCV4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmdn1Q9DCV4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmdn1Q9DCV4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmdn1Q9DCV4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmdn1Q9DCV4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms