Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ndufa8Q9DCJ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ndufa8Q9DCJ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ndufa8Q9DCJ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ndufa8Q9DCJ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ndufa8Q9DCJ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ndufa8Q9DCJ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ndufa8Q9DCJ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ndufa8Q9DCJ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ndufa8Q9DCJ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms