Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3fQ9DCH4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3fQ9DCH4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eif3fQ9DCH4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms