Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmgn3Q9DCB1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmgn3Q9DCB1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn3Q9DCB1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn3Q9DCB1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn3Q9DCB1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms