Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc97Q9DBT3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc97Q9DBT3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc97Q9DBT3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc97Q9DBT3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms