Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ftsj3Q9DBE9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ftsj3Q9DBE9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms