Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tysnd1Q9DBA6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tysnd1Q9DBA6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms