Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pop5Q9DB28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pop5Q9DB28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pop5Q9DB28 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms