Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc54Q9DAL3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc54Q9DAL3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc54Q9DAL3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms