Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd8Q9DA37 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Samd8Q9DA37 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd8Q9DA37 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd8Q9DA37 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms