Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pradc1Q9D9N8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms