Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Cntd1Q9D995 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntd1Q9D995 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms