Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700123K08RikQ9D991 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700123K08RikQ9D991 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700123K08RikQ9D991 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700123K08RikQ9D991 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700123K08RikQ9D991 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700123K08RikQ9D991 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700123K08RikQ9D991 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700123K08RikQ9D991 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700123K08RikQ9D991 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700123K08RikQ9D991 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700123K08RikQ9D991 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700123K08RikQ9D991 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700123K08RikQ9D991 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms