Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23bQ9D8T4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tvp23bQ9D8T4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms