Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn22Q9D7U6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cldn22Q9D7U6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cldn22Q9D7U6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn22Q9D7U6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms