Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chmp5Q9D7S9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chmp5Q9D7S9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Chmp5Q9D7S9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp5Q9D7S9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms